Вернулся чтобы начертить на стене закодированное послание с цифрами для Дезмонда. Ведь Минерва намекнула ему, что в будущем должен появиться некий Дезмонд и яблоко это предназначалось для него. И еще (это лично мое мнение)он мог вернуться на виллу для того, чтобы по человечески похоронить тело убитого дяди Марио. Просто разработчики не стали упоминать об этом в игре.
Хотя странно почему после 1507 года он не вернулся опять, чтобы начать восстанавливать виллу аудиторе ?
Возможно Эцио не успел это сделать т.к после окончания событий АСВ вскоре скончался. Возраст то был у него уже почтенный...